在澳门申请商标的流程分为：
向经济局知识产权厅提出申请--初步审查--刊登政府公告（异议期两个月）—实质审查（有无人反对或有无工业产权法律制度199条规定的不予注册的情形）—批给—刊登批给公告（上诉期一个月）—领取证书 (7年有效）。
其中，异议期指的是刊登申请之后的两个月内，任何人皆可提出异议；上诉期是指刊登批给公告次日之后的一个月，任何人皆可向初级法院提起诉讼，请求撤销经科局的批给行为。
上述两个期限有以下几点不同：
一、针对的主体不同
异议所针对的，是商标申请人；诉讼所针对的，是经济局。
二、费用不同
异议需要向经济局交纳800元费用，诉讼需要向法院交纳诉讼费，诉讼费的多少依据案件的利益值来计算，此类案件，通常原告会把利益值定在101万澳门币，以求可以上诉到终审法院。
三、代理人不同
异议，同申请一样，可以委托澳门的律师、个人或代理机构代理；诉讼，只能委托律师代理，且必须委托律师代理。
四、商标申请人的地位不同
异议，商标申请人是必然的主体，是被异议人；
而上诉期的诉讼，被告是经济局，商标申请人可作为第三人参加诉讼，亦可选择不参加诉讼，而由经济局去独立应诉。
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